Aspetos celulares/genéticos da doença do declínio do sobreiro

A Universidade do Algarve dedicou-se ao longo dos anos ao estudo de aspetos relacionados com a doença do declínio do sobreiro dando especial enfâse ao conhecimento dos fatores celulares/genéticos que poderiam estar relacionados com a doença, não descurando a ideia de que numa doença coexistem várias entidades que interagem e que assumem diferentes papeis no perfil de evolução da doença. Em particular, nestes estudos, as entidades mais estudadas foram o hospedeiro, o sobreiro (Quercus suber), e o agente infecioso Phytophthora cinnamomi, um oomiceta de desenvolvimento filamentoso que existe no solo associado ao sistema radicular dos hospedeiros.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Drosophila models of neuromuscular disorders: From morphology to behavior

RESUMO: As doenças neurodegenerativas, que podem originar ataxia ou demência, são doenças incuráveis e debilitantes que têm como consequência a degeneração progressiva seguida de morte neuronal. O mecanismo que provoca a neurodegeneração não é totalmente conhecido, sabendo-se apenas que está associado a múltiplas vias e contribuições genéticas. Dada a complexidade e variedade de mecanismos patológicos, um tratamento eficaz para este tipo de distúrbio é difícil de alcançar. Uma forma de contornar esta dificuldade, é através da promoção da complexidade neuronal de células ainda funcionais como meio de retardamento da progressão da doença. Ao caracterizar a morfologia e composição sináptica de vários modelos de neurodegeneração usando Drosophila melanogaster, o objetivo é averiguar se existe um alvo específico comum que possa retardar este sintoma. Para isto, foi utilizado como recurso um knocdown neuronal de genes associados a duas doenças neuromotoras, a Neurodegeneração associada à cinase do Ácido Pantoténico e a Paraplegias Espáticas Hereditárias. Para além disto, análises comportamentais locomotoras utilizando vários ensaios com diferentes sensibilidades foram realizadas em várias fases do ciclo de vida da mosca da fruta, através da utilização de knocdown específico para neurónio e células da glia para modelos de Esclerose Lateral Amiotrófica, Atrofia Muscular Espinhal, PKAN e HSP. Aqui, verificou-se que todos os genótipos estão associados a uma função locomotora diminuída que parece ser dependente das proteínas que foram anuladas nos neurônios e na glia. Este trabalho contribui para a compreensão da composição sináptica dos modelos de doença acima referidos que poderá ser utilizado como fator determinante para encontrar uma via que contorne a neurodegeneração através do aumento da complexidade neuronal. Para a PKAN, dado que muito pouco se sabe acerca desta doença, este trabalho contribui para a perceção de mais uma via que induz neurodegeneração e quais as alterações sinápticas possivelmente associadas.ABSTRACT: Neurodegenerative disorders are one of the most common illness manifestations worldwide. They have a chronic and progressive display, characterized by synaptic malfunction that then evolve to irreversible neuronal death. The mechanism behind neurodegeneration is not fully understood and can have several associated pathways and genetic contributions. Given that a treatment suitable for all forms of neurodegeneration is hard to get, one idea to overcome this issue is to promote neuronal complexity in the non-affected neurons, to try to delay the progression of these type of disorders. By characterizing the synaptic composition of several examples of Drosophila melanogaster models of neurodegenerative diseases, we intended to explore whether there is a specific target that can be targeted to slow neurodegeneration. Using cell type specific RNAi, we induce neuronal knockdown of genes associated with Pantothenate Kinase Associated Neurodegeneration and Hereditary Spastic Paraplegia. Several features of synaptic morphological and composition were addressed at the Drosophila NMJ. Also, behavior analyses using several assays with different sensitivities were performed in several stages of the Drosophila life cycle. Using neuronal or glial specific RNAi against proteins associated with Amyotrophic Lateral Sclerosis, Spinal Muscular Atrophy, PKAN and HSP, we show that all of these genotypes are associated with impaired locomotor function that seems to be dependent on the proteins that were knockdown in neurons and in wrapping glia cells. This work contributes to the understanding of the synaptic composition of HSP and PKAN disease models, that can be used to help us target downstream pathways, that will lead to increase structural plasticity as a way to promote neuronal complexity and overcome neurodegeneration. For PKAN, as very little information is available, it contributes to the understanding of the underlying causes of the disorder and to provide insights in which are the synaptic alterations behind patients with mutations in PanK2

Protein markers for the identification of cork oak plants infected with phytophthora cinnamomi by applying an (α, β)-k-feature set approach

Cork oak decline in Mediterranean forests is a complex phenomenon, observed with remarkable frequency in the southern part of the Iberian Peninsula, causing the weakening and death of these woody plants. The defoliation of the canopy, the presence of dry peripheral branches, and exudations on the trunk are visible symptoms used for the prognosis of decline, complemented by the presence of Phytophthora cinnamomi identified in the rhizosphere of the trees and adjacent soils. Recently, a large proteomic dataset obtained from the leaves of cork oak plants inoculated and non-inoculated with P. cinnamomi has become available. We explored it to search for an optimal set of proteins, markers of the biological pattern of interaction with the oomycete. Thus, using published data from the cork oak leaf proteome, we mathematically modelled the problem as an α, β-k-Feature Set Problem to select molecular markers. A set of proteins (features) that represent dominant effects on the host metabolism resulting from pathogen action on roots was found. These results contribute to an early diagnosis of biochemical changes occurring in cork oak associated with P. cinnamomi infection. We hypothesize that these markers may be decisive in identifying trees that go into decline due to interactions with the pathogen, assisting the management of cork oak forest ecosystems.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Utilização da realização de imagens animadas em função do ensino das ciências físicas e naturais

Este artigo reporta uma primeira utilização da realização de um filme animado proposta a um conjunto de alunos, professores do ensino básico, como estratégia na aquisição de competências no contexto das atividades em ensino de ciências. As autoras conduziram os alunos numa experiência de conjugação de técnicas de produção de filmes animados com metodologias de delimitação e comunicação de conteúdos científicos, tendo em vista a sua implementação futura enquanto estratégia no ensino das ciências físicas e naturais no ensino básico. O artigo apresenta os objetivos e procedimentos desenvolvidos no processo, assim como a avaliação dos resultados obtidos após análise

Performance of machine learning algorithms for forest species classification using WorldView-3 data in the Southern Alentejo region, Portugal

Recent advances in remote sensing technologies and the increased availability of high spatial resolution satellite data allow the acquisition of detailed spatial information. These data have been used for monitoring the Earth's surface, namely monitoring land use land cover, quantifying biomass and carbon, and evaluating the protection and conservation of forest areas. O WorldView-3 is a high spatial resolution satellite (0.50m) with 8 multispectral bands (visible and infrared) which allows obtaining detailed data from the Earth's surface. This study aims to map the forest occupation by specie with two WoldView-3 images, and to evaluate the performance of machine learning classifiers (maximum likelihood, support vector machine and random forest) in two regions of Alentejo, south of Portugal. The main forest species are Quercus suber in one region and Quercus rotundifolia in another. The procedures performed were multiresolution image segmentation and object-oriented classification based on 4 bands (blue, green, red and near infrared). As auxiliary data, vegetation indices (NDVI and SAVI) and principal components were calculated. In the object-oriented classification process, the three classifiers were tested. The support vector machine classifier was the one that presented the best accuracy (kappa and overall accuracy), for both images, allowing to obtain good results in the identification of forest species. In the image dominated by Quercus suber, the values of kappa and overall accuracy were 90% and 95%, and for the image where Quercus rotundifolia predominated, 90% and 96% respectively. The methodology applied to the high spatial resolution satellite data showed very good results in the identification and mapping of main forest species. Higher precision values stand out for the image where the Quercus rotundifolia predominates, where there is less spectral variation, namely fewer land use classes, thus reducing errors between classes that may be spectrally similar

Study of halitosis in patients with chronic caseous tonsillitis treated by 'CO IND. 2' laser cryptolysis

Orientador: Ester Maria Danielli NicolaTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias MedicasResumo: Halitose é um sintoma constrangedor com grande impacto social. Afeta milhões de pessoas, no mundo todo, que gastam muitos recursos em produtos na tentativa de obter a melhora do hálito. Uma abordagem científica da halitose justifica-se, uma vez que esta diminui a qualidade de vida e pode ser indicativa de doenças que necessitam de diagnóstico e tratamento específico. Inicialmente, foi elaborado um protocolo de avaliação da halitose baseado na literatura e na experiência pessoal, com o objetivo de minimizar custos, evitar exames desnecessários e orientar o diagnóstico. A segunda etapa do trabalho consistiu na mensuração objetiva do hálito (através da técnica de Halitometria dos Compostos Sulfurados Voláteis) em uma população com Tonsilite Crônica Caseosa (TCC), pois esta apresenta íntima relação com a queixa de halitose. O perfil halitométrico dos portadores de TCC ainda não havia sido descrito. Observou-se que a presença do cáseo é um fator preditivo de halitometria anormal nessa população. Na terceira etapa, foi estudado o impacto da criptólise por coagulação com laser de CO2 em indivíduos portadores de TCC e queixa de halitose. A técnica demonstrou ser segura e bem tolerada, e os valores das halitometrias foram normalizados após o tratamento, em virtude da diminuição da formação de cáseosAbstract: Halitosis is a very constraint symptom with a significant social impact. It is estimated that halitosis affects millions of people and these people regularly spend resources in products in order to improve their halitus. The study of halitosis in a scientific approach is justified once halitosis causes social restriction, decreases life quality and can be an indication of serious diseases that need diagnosis and specific treatment. Initially, a halitosis proposal for assessment protocol was elaborated based on the literature and on personal experience, with the objective of minimize costs, avoid unnecessary procedures and orientate diagnosis. The second part was the mensuration of halitosis (through the Volatile Sulphur Compounds Halitometry) in a population with Chronic Caseous Tonsillitis (CCT), since this disease is strongly related to the halitosis complaint. The halitometry profile in patients with CCT had not yet been described. In this study it was observed that caseum presence is a predictive factor for abnormal halitometry. On the third part, the impact of CO2 laser cryptolysis by coagulation in patients with CCT and halitosis complaint was studied. The technique using CO 2 laser ablation demonstrated to be safe, well tolerated, and halitometry values became normal after treatment, due to the decrease in caseum formationDoutoradoCiencias BiomedicasDoutor em Ciências Médica

Risk factors for antisocial behavior in children: comparison between boys and girls

Recognizing the importance of assessing the risk of antisocial behavior, this study aimed to characterize the risk factors for the occurrence of antisocial behavior, seeking to understand if there are differences between boys and girls. Eightyfive cases of children referred by the promotion and protection system due to the display of antisocial behaviors were reviewed. A total of 65 were boys and 20 were girls, aged between six and eleven years. Data collection was performed using the Portuguese version of the risk assessment instruments Early Assessment Risk List for boys and for girls. Gender differences were assessed, with boys exhibiting a higher risk level for antisocial behavior, adopting more serious behaviors (e.g., impulsive behaviors). Girls engaged in less serious behavior (e.g., disrespect). By characterizing the most prevalent risk factors, the results of this study may contribute to the identification of intervention priorities.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Estudo da biodiversidade molecular de Quercus suber e caracterização de genes envolvidos na resposta de defesa à infecção por Phytophthora cinnamomi

O sobreiro (Quercus suber L.) é uma espécie autóctone que se encontra distribuída em todo o território de Portugal Continental. São excepção as regiões montanhosas mais frias do norte e centro, as regiões salinas junto ao litoral e as zonas do interior de acentuada aridez. Os indivíduos desta espécie apresentam características morfológicas muito variadas com ocorrência de diversas gradações entre caracteres do mesmo órgão e diferentes graus de tolerância, aparente, à doença do declínio. A semelhança genómica descrita dentro do género Quercus determina a ausência de barreiras reprodutivas e possibilita fenómenos de hibridação nos povoamentos mistos de Q. suber e Q. rotundifolia. O recurso à análise do DNA para determinação do perfil genético dos indivíduos de uma espécie, consiste no método mais recente de individualização biológica. No presente estudo, foi avaliada a variabilidade genética em Q. suber por AFLP (amplified fragment length polymorphism), com cinco combinações de primers diferentes, que permitiram diferenciar 313 árvores provenientes do Algarve, Alentejo e Trás-os-Montes, de acordo com o seu genótipo. O perfil genético de cada sobreiro resultou da análise de 291 loci aleatórios do genoma, presentes na forma de fragmentos monomórficos e polimórficos. A avaliação quantitativa das semelhanças ou dissemelhanças entre os indivíduos foi determinada pelo método de análise de dados/taxonomia numérica. A percentagem de polimorfismo detectada nos sobreiros é de 71 % e é indicadora de índices elevados de variabilidade na espécie. A diversidade genética é semelhante nas populações estudadas do Algarve, Alentejo e Trás-os-Montes. A elevada variação fenotípica que se observa em Q. suber ao nível da qualidade da cortiça produzida e da aparente tolerância à doença do declínio é reflectida nos padrões AFLP. Os valores dos coeficientes de semelhança genética variam entre 0,88 e 0,61, o que significa que, apesar da elevada diversidade genética, os sobreiros partilham entre si 60 % do genoma. No grupo dos 313 indivíduos de Q. suber observa-se uma tendência para a separação em dois subgrupos. Na análise por AFLP com uma das combinações de primers, a combinação I9, foram incluídas 52 azinheiras provenientes das mesmas três regiões, Algarve, Alentejo e Trás-os-Montes, dos sobreiros. Duas destas azinheiras foram estudadas, também, com as outras quatro combinações de primers referidas para os sobreiros. Em todas as combinações de primers houve diferenciação entre os 313 indivíduos da espécie Q. suber e os dois indivíduos da espécie Q. rotundifolia, em concordância com a classificação sistemática destes Quercus. Na análise em que se incluíram as 52 azinheiras e os 313 sobreiros, identificaram-se indivíduos pertencentes a uma terceira espécie. Através da determinação de perfis genéticos de indivíduos de espécies diferentes do género Quercus é possível determinar as relações filogenéticas existentes entre eles. Um dos 291 marcadores AFLP está presente em quase todas as azinheiras e em onze sobreiros e este facto revela que pode ter sido adquirido por hibridação entre as duas espécies de Quercus. A metodologia usada permitiu identificar marcadores moleculares potencialmente correlacionados com fenótipos de tolerância à doença do declínio e à qualidade da cortiça. Alguns marcadores só estão presentes em sobreiros de determinada região e podem ser o resultado dum processo de adaptação ao meio. Em Portugal e Espanha a doença do declínio afecta, de um modo geral, os povoamentos de sobreiro e azinheira, atinge indivíduos de todas as idades e manifestase na forma de declínio lento ou morte súbita. O fungo do solo, Phytophthora cinnamomi, aparece invariavelmente associado aos locais de declínio e tem sido isolado, com frequência, a partir de raízes de sobreiros e azinheiras. Q. suber e Q. rotundifolia são, portanto, hospedeiros de P. cinnamomi e o fungo é capaz de colonizar os tecidos, sendo desconhecidos os mecanismos moleculares da interacção entre o hospedeiro e o agente patogénico. Através da análise do RNA mensageiro, por cDNA-AFLP, de raízes de Q. suber e Q. rotundifolia infectadas com P. cinnamomi, de folhas de plântulas de sobreiros cultivados em solos artificialmente infestados e de folhas de sobreiros localizados em locais de declínio, naturalmente infestados com o fungo, foram identificados fragmentos de genes que se expressam de forma diferencial durante a interacção. As sequências de quatro destes fragmentos apresentam homologia com genes relacionados com o sistema de defesa noutras espécies de plantas. As sequências nucleotídicas foram determinadas a partir dos cDNAs correspondentes obtidos por RACE-PCR ou, alternativamente, a partir dos genes isolados num banco genómico de Q. suber em Lambda FIX II escrutinado com sondas específicas. Foram identificados e caracterizados em Q. suber, os genes QsCAD1, QsRPc, QsPDI e QsRSH que codificam uma cinamil álcool desidrogenase 1, uma proteína de resistência a P. cinnamomi, uma isomerase de pontes dissulfureto proteica e uma proteína do tipo RelA/SpoT, respectivamente. Pelo menos três destes genes estão potencialmente envolvidos na resposta à infecção por P. cinnamomi; com efeito a expressão de QsCAD1, QsRPc e QsPDI aumenta durante as primeiras 24 horas de interacção. É conhecido que o sistema de defesa nas plantas é multifacetado e que a transcrição dos genes do metabolismo de fenilpropanóides é activada durante a interacção com agentes patogénicos. A partir de fragmentos obtidos por PCR com primers de sequência heterogénea definidos a partir de sequências conhecidas de genes do metabolismo de fenilpropanóides doutras espécies de plantas, foram determinadas sequências nucleotídicas parciais codificando uma peroxidase (QsPOX), uma cinamil álcool desidrogenase 2 (QsCAD2) e uma fenilalanina amónia liase (QsPAL) em Q. suber. Com base nesta informação foram clonados, sequenciados e caracterizados, parcial ou completamente, o cDNA e/ou DNA dos genes QsPOX (1 e 2), QsCAD2 e QsPAL que codificam duas peroxidases catiónicas, uma cinamil álcool desidrogenase e uma fenilalanina amónia liase, respectivamente. A expressão destes genes foi analisada por RT-PCR e hibridação com sondas específicas marcadas com digoxigenina, a partir de RNA total extraído de raízes de Q. suber que estiveram em contacto com o fungo durante 24 horas, verificando-se que QsPOX2 e provavelmente, QsPOX1, estão envolvidas na resposta de defesa. Relativamente aos genes QsCAD2 e QsPAL os resultados não foram conclusivos. Tendo em consideração a homologia entre as sequências de aminoácidos deduzidas dos genes identificados em Q. suber com a de proteínas já caracterizadas noutras espécies, foi possível conceber um modelo hipotético que ilustra os acontecimentos iniciais da interacção entre o fungo e o hospedeiro. Deste modo, considera-se que a infecção de Q. suber por P. cinnamomi apresenta contornos de interacção compatível e incompatível. O fungo induz a expressão de genes potencialmente implicados na desactivação de factores de virulência (toxinas) e de genes de defesa implicados no reconhecimento de factores de avirulência. A variante da doença do declínio denominada “morte súbita” estaria associada à produção duma isoforma do produto do gene QsCAD1, incapaz de converter o factor de virulência (toxina) produzido pelo fungo, num produto não tóxico para a célula. Num sobreiro que sofreu morte súbita foi identificado um fragmento polimórfico deste gene que apoia esta hipótese. O declínio lento resultaria da resistência parcial ao fungo, relacionada com a rapidez de reconhecimento dos factores de avirulência.Universidade do Algarve, Faculdade de Engenharia de Recursos Naturai

O novo sistema de normalização contabilística: Impacto da sua adopção numa empresa pública

O estudo realizado tem como objectivo avaliar os impactos da adopção do novo SNC, à data de transição, nos activos e passivos de uma empresa portuguesa de transporte ferroviário do sector público. Concluiu-se que os principais impactos decorrem da adopção das NCRF 12 – Imparidade de Activos, NCRF 22 – Contabilização dos Subsídios do Governo e NCRF 27 – Instrumentos Financeiros. Estes impactos reflectem a forte componente capital intensivo da empresa, bem como a sua estrutura financeira sustentada essencialmente no apoio do Estado ao seu investimento e no recurso ao endividamento para cobrir as suas necessidades de financiamento de exploração e também de investimento, com o necessário recurso à cobertura de risco através de instrumentos financeiros. Assim, em resultado da adopção do novo normativo na empresa em estudo, é esperado uma diminuição muito significativa do seu Activo em resultado do reconhecimento de perdas por imparidade e um aumento do Passivo em consequência da alteração da forma de registo dos subsídios ao investimento e do reconhecimento do justo valor dos instrumentos financeiros de cobertura. Consequentemente é esperada uma diminuição muito significativa do Capital Próprio. O estudo realizado possibilitou ainda perspectivar uma evolução negativa dos indicadores financeiros em resultado da adopção do novo normativo, conduzindo a um agravamento da situação financeira da empresa.This study aims to evaluate the impacts of adoption of the new SNC, at transaction date, in the assets and liabilities of a State-Owned Portuguese railway company. The conclusions indicate that the principal impacts result from the adoption of NCRF 12 – Impairment of Assets, NCRF 22 – Accounting for Government Grants and NCRF 27 – Financial Instruments. These impacts reflect the strong capital intensive component of the company and its financial structure, which relies essentially in the State support to its investment and in indebtedness to cover its necessities of investment and exploration financing with the necessary covering of risk through financial instruments. Thus, in result of the new normative adoption in the company in study, it is expected a very significant reduction of its Asset as result of the recognition of impairment loss, and an increase of the Liabilities as consequence of changes in the accounting treatment of government grants and the recognition of the fair value of cover financial instruments. Consequently, it is expected a very significant reduction in the firm Equity. This study also permits to forecast the negative evolution of the financial indicators as result of the adoption of the new normative, leading to a deterioration of the company financial situation

As organizações à luz da positividade: contributos para a compreensão do capital psicológico e dos seus efeitos

Esta dissertação tem como principal objetivo contribuir para o conhecimento dos efeitos do capital psicológico num contexto organizacional. A presente tese encontra-se estruturada em três partes. Numa primeira parte procede-se à apresentação de uma revisão de literatura sobre o campo do comportamento organizacional positivo, em que este constructo se inscreve. A partir de uma reflexão crítica em torno deste enquadramento procura-se balizar teoricamente o constructo do capital psicológico, analisar os seus componentes, introduzindo uma distinção concetual entre estes e examinar o impacto de cada uma destas capacidades psicológicas para o indivíduo e para a organização. Esta primeira parte culmina numa reflexão crítica em torno do estado da arte neste domínio. Na segunda parte procede-se a uma descrição dos estudos empíricos realizados com o propósito de examinar algumas consequências do capital psicológico. Nesse sentido, centramos a nossa atenção na análise de algumas consequências do capital psicológico nas atitudes, intenções, comportamentos e desempenho no trabalho. Ainda nesta segunda parte examinamos o papel do capital psicológico nas decisões de seleção de pessoal, visando compreender o impacto deste na inserção profissional dos indivíduos. Por último, na terceira parte desta dissertação, traçamos as conclusões gerais a retirar deste trabalho, salientamos os seus principais contributos e limitações e destacamos potenciais linhas de investigação futura.This dissertation intends is to provide a deeper understanding of the effects of psychological capital in organizational contexts. This thesis is structured in three parts. In the first part a theoretical framework is developed regarding positive organizational behavior and positive organizational scholarship. Taking this as a point of departure, we proceed to the definition and delimitation of the psychological capital construct, analyse its components and introduce a conceptual distinction between these. It is also examined the impact of each of these psychological capacities for the individual and for the organization. A critical analysis on the state-of-the-art in psychological capital research finishes the first part of the dissertation. In the second part of this dissertation are described the empirical studies conducted in order to examine some consequences of psychological capital. Accordingly, we focus our attention on the analysis of some consequences of psychological capital on attitudes, intentions, behaviors and work performance. In this second part it is also examined the role of psychological capital in personnel selection decisions. Finally, in the third part of this thesis, general conclusions are drawn, the main contributions and limitations of these studies are highlighted and are presented potencial areas of future research